충북대학교 토목공학과는 국토건설이라는 당시의 국가적 명제에 발 맞추어 1969년 12월 입학정원 30명을 시작으로 신설되었고, 종합대학 승격을 위한 전 단계로 학부제가 실시되는 1970년도에 이공학부에 소속되어 있었다. 그 후, 국립대학 특성화사업으로 1979년 9월 건설특성화 학과로 지정되어 토목공학과가 발전할 수 있는 계기가 마련되었고, 이로 인해 입학정원이 325명으로 대폭 증가되었다.
건설특성화가 이루어지면서 외국인 교수를 초빙하여 교육의 국제화를 꾀하였고, 건설분야 특성화 연구지원과 계속적인 교수충원, 많은 예산확보 등 국가 차원의 대규모 지원을 받음으로써 학업, 연구 등 각종 실험·실습에 필요한 첨단시설을 다량 보유하는 등 외형적으로 괄목할 만한 성장이 이루어졌다.
1999년 고등교육법 개정에 따라 신입생모집이 학과단위에서 학과군 단위로 모집하게 되어 토목공학과는 건설공학군(토목공학과, 건축공학과, 도시공학과, 구조시스템공학과)의 4개 학과로 신입생을 선발하게 되었다.
이와 같이 토목공학과는 공과대학내에서 최대규모의 학과로서 2002년 현재까지 졸업생이 총 3,465명으로 어느 학과 보다 많은 졸업생을 배출하고 있으며, 이들은 사회 각계·각층에서 활발한 활동을 하고 있다.
현재에는 국내외 유명 대학에서 학위를 취득하신 12분의 교수님(명예교수 1인 포함)과 400여명의 학부생, 그리고 100여명의 석·박사과정 대학원생이 재학 중에 있으며, 토목공학의 전문 이론과 실험·실습을 통해 고급기술자를 양성하고 있다.